近邻成分分析法示例

近邻成分分析法是一种降维技术,旨在最大化最近邻分类的准确性。本文将通过一个简单的数据集来展示这种方法,并比较原始点空间与转换后的点空间。将使用Python的matplotlib库来绘制数据点,并使用scipy和sklearn库来实现NCA算法。

数据集的创建与可视化

首先,创建一个包含9个样本的数据集,这些样本来自3个不同的类别。将在原始空间中绘制这些点,并特别关注编号为3的点。点之间的连接线粗细与它们之间的距离成比例。

import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np from matplotlib import cm from scipy.special import logsumexp from sklearn.datasets import make_classification # 创建数据集 X, y = make_classification(n_samples=9, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_classes=3, n_clusters_per_class=1, class_sep=1.0, random_state=0) # 绘制原始点 plt.figure(1) ax = plt.gca() for i in range(X.shape[0]): ax.text(X[i, 0], X[i, 1], str(i), va="center", ha="center") ax.scatter(X[i, 0], X[i, 1], s=300, c=cm.Set1(y[i]), alpha=0.4) ax.set_title("原始点") ax.axes.get_xaxis().set_visible(False) ax.axes.get_yaxis().set_visible(False) ax.axis("equal")

在上述代码中,首先导入了必要的库,然后使用make_classification函数创建了一个数据集。接着,使用matplotlib的scatter函数来绘制这些点,并为每个点添加了文本标签。

学习嵌入与最近邻搜索

接下来,使用NeighborhoodComponentsAnalysis类来学习数据的嵌入,并在转换后的点空间中绘制这些点。然后,将使用嵌入后的数据来找到每个点的最近邻居。

from sklearn.neighbors import NeighborhoodComponentsAnalysis # 学习嵌入 nca = NeighborhoodComponentsAnalysis(max_iter=30, random_state=0) nca.fit(X, y) # 绘制嵌入后的点 plt.figure(2) ax2 = plt.gca() X_embedded = nca.transform(X) # 绘制连接线和点 for i in range(len(X)): ax2.text(X_embedded[i, 0], X_embedded[i, 1], str(i), va="center", ha="center") ax2.scatter(X_embedded[i, 0], X_embedded[i, 1], s=300, c=cm.Set1(y[i]), alpha=0.4) ax2.set_title("NCA嵌入") ax2.axes.get_xaxis().set_visible(False) ax2.axes.get_yaxis().set_visible(False) ax2.axis("equal") plt.show()

在这段代码中,首先创建了一个NeighborhoodComponentsAnalysis对象,并使用fit方法来学习数据的嵌入。然后,使用transform方法将原始数据转换到嵌入空间,并绘制转换后的点。

脚本运行时间

该脚本的总运行时间为0分钟0.150秒。

以下是一些与近邻成分分析法相关的其他示例:

  • 比较使用和不使用近邻成分分析法的最近邻
  • 使用近邻成分分析法进行降维
  • 在手写数字上进行流形学习:局部线性嵌入,Isomap...
  • 变分贝叶斯高斯混合模型的浓度先验类型分析
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